Охрана окружающей среды от загрязнения вредными веществами в результате воздушных выбросов, сточными водами, рациональное использование водных ресурсов - исключительно важная проблема в настоящее время. Ее решение в рыбоперерабатывающей промышленности направлено прежде всего на совершенствование технологии производства с целью снижения водопотребления, сокращение потерь продукции, сырья и отходов со сточными водами, широкое применение оборотного и повторного использования воды, разработку и внедрение эффективных методов очистки сточных вод, "мягких" бездымных технологий с замкнутым циклом воздухообмена, конденсацией примесей из воздушных выбросов и их полной очисткой, переход на бессточные системы водоснабжения.